June 12,2005
005--轉錄作用
記不記得， DNA 複製用半保留，可以一絲不差的製造新的，一模一樣的 DNA ？
轉錄作用其實是差不多的原理。
我所謂「差不多」，是指複製的時候一樣把 DNA 雙股解開，個別複製出新的核苷酸長鏈。雖然原理差不多，結果卻差很多。因為在轉錄以後，產物不是 DNA ，而是 RNA 。
RNA 和 DNA 差在哪裡？
首先， DNA 叫「去氧核糖核酸」， RNA 叫「核糖核酸」，這表示 DNA 比 RNA 少了一個氧原子﹔再來， DNA 含有的核苷酸是A、T、C、G， RNA 則含有A、「U」、C、G，所以A＝U配對，C≡G配對；還有， DNA 是雙股螺旋， RNA 則是單股鏈狀。
如果有一股 DNA 其中一段的序列是 ATTGCGTAGCTA，那它被複製出來的 DNA 會是互補的 TAACGCATCGAT；但是被轉錄出來的 RNA 則會是UAA－CGC－AUC－GAU。看到差別了嗎？T 不見了。
人家說「謠言止於智者」，因為話傳到最後總會失去它原本的意義。不必說傳話了，我常在想，我聽到的你說的話，真的是我以為的那個意思嗎？
（又來了，無可救藥的疑問。）
還有我說給你聽的話，你真的聽「懂」了嗎？
（真的是，無可救藥，停不了的疑問。）
傳話傳錯了或者聽話的人接收錯誤，那叫「突變」﹔最恐怖的是，說話的人說出來的就已經口是心非。
RNA 一開始就沒有 T 了。
你可能其實不知道 RNA 是要幹什麼用的，我可以簡單的告訴你。最後這些東西會變成蛋白質。而蛋白質是構成身體和維持正常生理功能的最主要物質（換句話說，如果沒有蛋白質，人就不成人形了）。
所以說天性如此，基因就是這樣口是心非一步一步的走下去，而且是無法打破的鐵則。人又怎麼能心口如一呢？
所以我才這樣無可救藥的，停不住的，迫切的，充滿著疑問啊！
甚至連我自己都不能相信了。
【專有名詞】
‧轉錄作用，transcription： DNA 上的遺傳密碼轉換成 RNA 的過程，之一。
004--岡崎片段
我是不是忘了告訴你， DNA 的複製是有方向性的？
DNA 兩股分開來進行複製的時候，必定是「從 5’端往 3’端的方向進行」。 DNA 的中文叫做「去氧核糖核酸」，顧名思義，裡面含有「去氧核糖」。去氧核糖是一種含有五個碳原子的糖，我們把這些碳原子照次序編號，從 1’到 5’… 我不太敢再講下去，因為極可能真的變成高中生物教材。總之那個「5’→ 3’」指的是 DNA 上碳原子的編號。
如我之前所說，兩股 DNA 上的核苷酸以 A＝T、C≡G 的規則進行配對，所以彼此互補，並且「反向平行」。一股是 5’→ 3’，那另一股就會是 3’→ 5’。
我知道不是很容易，但是你一定要看下去，因為這如同我們之間的關係，「反向平行」。
準備複製時， DNA 從底下把兩股分開，新的核苷酸從尾巴往前面複製。所以 5’→ 3’的那一股，新的核苷酸從 3’往 5’複製，正好可以以「反向平行」的順序，由 5’往 3’複製出新股﹔可是要在 3’→ 5’那一股複製新股時，問題就來了。依照反向平行的原則，新的核苷酸會由3’向5’複製，這行不通。根本不能接。
就跟你一樣啊，固執的誰都說不通。看起來浪漫又隨性的你，其實對自己的方向很堅持的。所以我們之間的強化玻璃才會這麼堅固，怎麼樣都打不破。
後來，日本的岡崎發現，在這一股無法直接由 3’→ 5’複製的 DNA 上，新的核苷酸會先逆向複製出一小段一小段 5’→ 3’的片段，再利用酵素把他們都連結起來。為的就是讓 DNA 能依照原來的方向複製。
利用小小的叛逆，完成自己的方向。
這是很「體制內」內的變通方式，因為固執。
這一股因為複製的速度會因此減慢，所以被叫作 lagging strand（延遲股）。你是不是也寧可延遲也要找到百分之百的愛情呢？所以話說回來，你還是很浪漫的嘛，浪漫又固執。
而我是那一股乖乖由 5’→ 3’複製的領導股（leading strand），輕輕的滑過你身邊，複製出跟你一樣的生活方式，自以為這樣就能更接近你，其實不過是被你一視同仁的過客。
誰是能讓你啟動複製的「引子」（primer）？誰是能讓你連結岡崎片段的酵素？
我多麼希望能讓你停下腳步，就算只讓你延遲一秒鐘也好。
【專有名詞】
‧岡崎片段（Okazaki fragment）：DNA 複製時延遲股上 5’→ 3’的DNA片段。
‧領導股（leading strand）：DNA 複製時由 5’→ 3’複製的新股 DNA。
‧延遲股（lagging strand）：DNA 複製時無法由 5’→ 3’複製的另一股DNA。
‧引子（primer）：啟動 DNA 複製的特殊片段。
003--半保留複製
想來我對愛情是極度缺乏安全感吧，才會永無止盡的懷疑著。
不同組成的 DNA 構成不同的基因，這些基因和蛋白質一起組成染色體。每一個體細胞裡都有同樣多的染色體（人類是 23 對，生殖細胞除外，僅半套 23 條）。
DNA 怎麼複製你知道嗎？要怎麼樣才能複製出相同的 DNA 片段？讓「每一個細胞裡都有同樣多的染色體」？
他們半保留。
DNA 的雙股螺旋在複製前會先打開，兩股分別作為模版，讓新的核苷酸依照 A＝T、C≡G 的規則進行配對（所以你知道，配對後的半條 DNA 與模版互補，而與模版原本的相對股一模一樣），合成兩條新的 DNA 。新的 DNA 中會有一股是新的，一股是原本的模版﹔這新的 DNA 又再分開，各自進行複製，變成四條 DNA ……依此類推， DNA 越來越多。
倍數成長是很驚人的，不是說把報紙折個五十幾次還是多少的，就能從地球到達月球嗎？
半保留是實驗作出來的結果，因為「全保留」跟「無保留」都被證實無法有效製造出相同的 DNA 。全保留固然得不到愛情，無保留的付出竟也是一場空，真是諷刺。
你的半保留複製不斷進行，到處都是你的形影﹔我給了全部的真心，卻換不回完整的自己。
【專有名詞】
‧半保留複製，semiconservative replication：DNA的複製方式。
‧模版，template：用來進行複製的「根據」。
002--雙螺旋
「雙螺旋的確是個了不起的分子，現代人大概有五萬年的歷史，人類文明最多只有一萬年，美國才二百年出頭；但是DNA及RNA已經存在了至少幾十億年。這麼久以來，雙螺旋就在那裡，充滿活力，而我們是地球上第一種曉得它存在的生物。」
──克立克（Francis Crick）
雙螺旋── 暈頭轉向，愛情的天梯。
50 年前，華生和克立克發現 DNA 的雙螺旋結構，還拿了諾貝爾獎。
DNA 由四個核苷酸構成──A、T、C、G。A 必定和 T 相接，C 必定和 G 相接。假設左邊那一股螺旋其中一段的順序是 ATTCG，右邊必定依序為 TTAGC。兩股就像梯子的左右兩側，中間相連的部份就是梯子的每一階。因為比重的不同，所以 DNA 無法呈直線，而以螺旋的型態呈現。
愛情本來是很簡單的事，卻表達的如此迂迴。努力猜測對方的喜怒哀樂，似乎是為了取悅彼此，但我給的，是你要的嗎？而你給的，又是我要的嗎？我們就像失衡的天平，拿捏不住輕重。
雙螺旋的兩股之間距離彼此相等，永遠相等。你知道這代表什麼嗎？他們是平行的。兩股彼此互補、缺一不可，但他們竟然是平行的。這兩股以氫鍵相連結，氫鍵看不見摸不到卻強而有力，所以兩股間有兩個奈米（註）的距離，這麼近，但是卻不能靠在一起。
就像我說的，我們彼此之間有一塊透明卻堅硬的強化玻璃。
雙螺旋每繞一周是十層階梯，3 .4 個奈米直徑。我一直很想不透，生命這種莫名其妙的東西，怎麼會以這麼幾何又規律的方式存在。人類跟猩猩的 DNA 只相差 3 ﹪，可是我們這麼不同；每一段愛情的過程都不一樣，但結果卻為什麼都是分開？
也許是因為幾百萬個核苷酸只要出一點差錯就有種族毀滅的危機，在愛情裡面就算遍體鱗傷也不會有人珍惜；相反的，最重要的那個人，通常是讓自己出錯的主要原因。
一個 A 變成 C 可能是人類演化的濫觴，擠牙膏的方式可能決定我們能不能在一起一輩子；這會是錯誤的開始，還是美麗的終止？
而天梯仍然高聳直入雲霄，我想看到頂端，卻被陽光刺痛了眼睛。
註：奈米為一長度單位，是公尺的十億分之一。
【專有名詞】
‧雙螺旋：double helix，DNA 的外型。
‧核苷酸：nucleotide，構成 DNA 的化學組成分之一。
001--性狀轉變
誰說愛情不能扯上遺傳學？
這是我最喜歡的領域之一，不管是傳統的遺傳計算或者是新進的分子生物，每一家的學派都很迷人。
我不是要討論人類的愛情關和遺傳學有什麼關係，而是要把遺傳學轉換成愛情。這年頭，什麼事情都跟愛情有關係。
不知道該說是借屍還魂還是某種殖民現象。
時間是 1928 年。科學家已經知道基因上有蛋白質和 DNA，但到底是何者將彷彿密碼一般的遺傳訊息世代相傳呢？
而你，你又為什麼一直在我心裡？在這麼多年，這麼多來去的人事滄桑以後，為什麼你還在這裡？
1928 年，徐志摩寫下《再別康橋》﹔詩人余光中出生﹔英國的格里夫茲發現生物體內有一種物質能讓遺傳密碼像魔術一樣的偷天換日…
肺炎雙球菌有兩種，一種在細胞外有黏呼呼的莢膜，能讓動物生病﹔另一種沒有莢膜，粗糙的菌落對動物不具致病性。把具有莢膜的雙球菌注射近老鼠體內，老鼠得到肺炎而死。如果把細菌加熱呢？那就像打了一針食鹽水，沒什麼改變。
奇妙的情形出現了。格里夫茲把有莢膜的細菌加熱殺死，然後跟沒有莢膜不具致病性細菌一起打進老鼠體內，結果，老鼠死掉了。在老鼠體內，能發現活著的，具有莢膜的肺炎雙球菌！！
發生了什麼事？
死掉的，有殺傷力的細菌，跟活著的，沒有殺傷力的細菌，到底做了什麼？
已死亡的莢膜細菌把體內的某種東西轉移到活著的無莢膜細菌體內，讓他的殺傷力能夠延續，即使本身的生命已經結束了。這種轉移超越了生與死的界線。過程到今天仍然神秘而未可知，即使在 1944 年，美國的艾佛利已經證實性狀轉移的物質就是 DNA，還是沒有人知道這究竟是怎麼一回事。
我在你面前，你不知道我愛你﹔你在我心裡，一舉一動都已經轉移，我是你的殖民地。
【專有名詞】
‧性狀轉變，transformation－遺傳物質在細胞間轉移的過程。
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