July 12,2005
What is -Omics?
(以下節錄自: http://www.nhri.org.tw/nhri_org/ca/main4_7.htm)
基因體學、蛋白質體學、與生物資訊學在開發癌症藥物的角色
國家衛生研究院 癌症研究組 莊雙恩
美國國家癌症研究院 (NCI) 分子藥理學實驗室主持人魏斯坦醫師 (John N. Weinstein, MD, Ph.D.) 以上面這個題目,應邀在第六屆TCOG年會暨Dr. Paul Carbone紀念學術研討會上 (2002.12.21) 發表精彩而豐富的演講,爲未來的癌症醫學與藥物開發的相關生物資訊學勾勒出充滿希望的遠景。
「體學」的概念
接著魏斯坦醫師為大家介紹愈來愈流行的「體學」(或稱「組學」,Omics) 概念。他說,研究細胞、組織或是整個生物體內某種分子 (DNA、RNA、蛋白質、代謝物或其它分子) 的所有組成內容,就稱為「體學」(3)。例如Genomics (基因體學)、Proteomics (蛋白質體學)、Transcriptomics (轉錄體學)、Kinomics (動力體學)、CHOmics (醣類體學)、Immunomics (免疫體學)、Toxicomics (毒理體學)、Metabonomics/Metabolomics (代謝體學)、Clinomics (臨床體學)。另外還有複合形式的「體學」,例如 Functional Genomics (功能基因體學)、Structural Genomics (結構基因體學)、Pharmacogenomics (藥理基因體學)、Pharmacoproteomics (藥理蛋白質體學)、Ecomics (生態體學=Ecogenomics+Ecoproteomics)、Pharmacomethylomics (藥理甲基化體學,研究基因啟動子區域DNA甲基化的情形,與癌症的發生和癌細胞的抗藥性有關)(4)。
「體學」研究與傳統的研究方式並沒有孰好孰壞的問題,兩者都需要一樣的創造力、判斷力與實驗技巧,其分野在於「見樹」與「見林」。最好的研究必須是見樹又見林。魏斯坦醫師特別強調研究上三種層次的協同性,第一層是「體學」研究與基於假說所進行的傳統研究,第二層是實證科學與生物資訊學,第三層是各種分子型態數據之間的整合 (可稱為「整合體學/IntegromicsTM」。沒有任何單一分子型態數據可以代表全貌)。因此,現代化的藥物開發應該廣泛結合以下的各種革命性的方法:分子生物學、組合化學與生物學、縮 (微) 小化技術、新穎的高科技分析技術、電腦輔助的藥物設計、自動化與機器手臂、生物資訊學與化學資訊學及「體學」等等。
基因體學、蛋白質體學、與生物資訊學在開發癌症藥物的角色
國家衛生研究院 癌症研究組 莊雙恩
美國國家癌症研究院 (NCI) 分子藥理學實驗室主持人魏斯坦醫師 (John N. Weinstein, MD, Ph.D.) 以上面這個題目,應邀在第六屆TCOG年會暨Dr. Paul Carbone紀念學術研討會上 (2002.12.21) 發表精彩而豐富的演講,爲未來的癌症醫學與藥物開發的相關生物資訊學勾勒出充滿希望的遠景。
「體學」的概念
接著魏斯坦醫師為大家介紹愈來愈流行的「體學」(或稱「組學」,Omics) 概念。他說,研究細胞、組織或是整個生物體內某種分子 (DNA、RNA、蛋白質、代謝物或其它分子) 的所有組成內容,就稱為「體學」(3)。例如Genomics (基因體學)、Proteomics (蛋白質體學)、Transcriptomics (轉錄體學)、Kinomics (動力體學)、CHOmics (醣類體學)、Immunomics (免疫體學)、Toxicomics (毒理體學)、Metabonomics/Metabolomics (代謝體學)、Clinomics (臨床體學)。另外還有複合形式的「體學」,例如 Functional Genomics (功能基因體學)、Structural Genomics (結構基因體學)、Pharmacogenomics (藥理基因體學)、Pharmacoproteomics (藥理蛋白質體學)、Ecomics (生態體學=Ecogenomics+Ecoproteomics)、Pharmacomethylomics (藥理甲基化體學,研究基因啟動子區域DNA甲基化的情形,與癌症的發生和癌細胞的抗藥性有關)(4)。
「體學」研究與傳統的研究方式並沒有孰好孰壞的問題,兩者都需要一樣的創造力、判斷力與實驗技巧,其分野在於「見樹」與「見林」。最好的研究必須是見樹又見林。魏斯坦醫師特別強調研究上三種層次的協同性,第一層是「體學」研究與基於假說所進行的傳統研究,第二層是實證科學與生物資訊學,第三層是各種分子型態數據之間的整合 (可稱為「整合體學/IntegromicsTM」。沒有任何單一分子型態數據可以代表全貌)。因此,現代化的藥物開發應該廣泛結合以下的各種革命性的方法:分子生物學、組合化學與生物學、縮 (微) 小化技術、新穎的高科技分析技術、電腦輔助的藥物設計、自動化與機器手臂、生物資訊學與化學資訊學及「體學」等等。
引用URL
http://cgi.blog.roodo.com/trackback/263494