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十一月中，後金兵鋒突至北京城外，十二月底北京城內戶部原先貯存的糧餉供應守城軍丁和外地援軍已不敷支應，〈庫貯將竭憂危無計疏〉說五十天之內已經動用了百萬舊餉新餉，庫銀剩下十餘萬兩，糧食存量也不足，崇禎隨後下旨命戶部把軍費造冊呈報。

一月七日的〈奉旨開報軍興錢糧疏〉內載自崇禎二年十月二十八日到十二月三十日，舊庫新庫共耗用銀一百零五萬餘兩，扣除原本正常花費，額外支用了銀四十五萬餘兩，主要是用於糧米塩菜，太倉只剩銀五萬六千餘兩。幾天後的〈軍興匱竭據實剖衷疏〉支用銀兩這個數字增加到四十七萬餘兩。


雖然各地都有解送錢糧入京，但因為害怕敵軍仍在京畿出沒，外地的錢糧無法運進北京城，〈設法轉輸外解以濟軍興疏〉中即提案河間加派軍隊護送錢糧入京。


到了一月初糧餉情況尚未好轉，〈措發延綏關寧援兵月餉疏〉、〈奏繳十二月分京軍續支行糧疏〉都提到了戶部拮据，因此已暫時不發放守城兵丁餉銀，並以〈責成道府嚴催外解疏〉嚴令河間府官員在一月中必須將錢糧運入。


河間錢糧在一月中開始運入京城，但運到的數量仍不足支用，戶部除了再下令催運之外，在一月底向崇禎上奏〈急缺錢糧借帑接濟疏〉求借帑銀八萬兩。崇禎把戶部罵了一頓，撥給五萬兩帑銀救急。


二月初情況總算好轉，二月十二日的〈恭報解到塩課及新舊餉銀疏〉上奏運到新舊餉銀四十八萬餘兩，以及金花銀、京糧銀、宣鎮銀、衙門銀等約十八萬餘兩。戶部隨及在十四日的〈補還内帑金花子粒二項疏〉中承諾會盡快把向皇上借的五萬兩帑銀還清。


這段期間戶部不只一次借用內帑，崇禎三年四月二十日的〈遵旨回奏補還帑銀〉提到，該月十八日崇禎派司禮監太監要求戶部奏報近來所借的款項，結果列了四筆共二十一萬餘兩，已繳還十六萬餘兩，還欠五萬餘兩，畢尚書在奏章後面美言奉承一番要求繼續拖欠，皇上接受了他的要求。